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      迄今國(guó)內(nèi)最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組變異圖譜,有望優(yōu)化腫瘤治療方案

      發(fā)布時(shí)間:2023-06-28 10:26 文章作者:云鴻科技 瀏覽次數(shù):702
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      近日,復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院大腸外一科徐燁教授聯(lián)合精準(zhǔn)腫瘤中心胡欣教授,成功繪制出迄今國(guó)內(nèi)最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組變異圖譜,揭示了中國(guó)人群結(jié)直腸癌基因組變異特征,并鑒定出其中可精準(zhǔn)預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌靶向治療和免疫治療療效的基因組標(biāo)志物,為結(jié)直腸癌的基礎(chǔ)臨床轉(zhuǎn)化拓寬了思路。


      相關(guān)研究成果日前在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《胃腸病學(xué)》發(fā)表(影響因子:34分)。


      結(jié)直腸癌是嚴(yán)重威脅我國(guó)居民生命健康的惡性疾病。“隨著居民生活方式的變化和健康篩查意識(shí)的提升,我國(guó)結(jié)直腸癌發(fā)病人數(shù)越來(lái)越多”,徐燁教授表示,“然而,高化療耐受和高復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移率仍是阻礙結(jié)直腸癌患者獲得長(zhǎng)期生存的‘瓶頸’,約20%~25%的患者在初診時(shí)即伴隨轉(zhuǎn)移,另有30%的Ⅰ~Ⅲ期和65%的Ⅳ期患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)或二次轉(zhuǎn)移。由于結(jié)直腸癌復(fù)雜的分子發(fā)病機(jī)制,致使其具有高度的腫瘤異質(zhì)性。因此,尋找結(jié)直腸癌個(gè)體化腫瘤靶標(biāo),探索結(jié)直腸癌的精準(zhǔn)治療,對(duì)于打破結(jié)直腸癌治療‘瓶頸’具有重要臨床轉(zhuǎn)化價(jià)值?!?/span>


      目前,以分子免疫治療、靶向治療等治療方式為代表的精準(zhǔn)策略已經(jīng)在結(jié)直腸癌研究領(lǐng)域廣泛開(kāi)展。然而,當(dāng)前相關(guān)治療標(biāo)準(zhǔn)和治療指南絕大多數(shù)參考人群為西方群體,基于中國(guó)人群的結(jié)直腸癌基因組變異特征圖譜仍然處于“空白”狀態(tài)。


      為此,復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院大腸外一科主任徐燁教授聯(lián)合精準(zhǔn)腫瘤中心副主任胡欣教授,展開(kāi)了基于中國(guó)人群的大規(guī)模結(jié)直腸癌特異性多基因檢測(cè)隊(duì)列研究。

      探索化療敏感性差的“謎題”,繪制迄今國(guó)內(nèi)最大規(guī)模結(jié)直腸癌基因組變異圖譜

      該研究基于中國(guó)人群結(jié)直腸腫瘤的前瞻性隊(duì)列,納入了869例結(jié)直腸癌患者,其中包括586例早期和283例晚期結(jié)直腸癌。利用887基因Panel測(cè)序,繪制體系和胚系變異圖譜,描述了中國(guó)人群結(jié)直腸癌臨床病理和基因組變異特征。這也是迄今國(guó)內(nèi)最大規(guī)模的結(jié)直腸癌前瞻性靶向測(cè)序平臺(tái)和臨床樣本隊(duì)列。

      基因圖譜顯示,在結(jié)直腸癌體系變異方面,突變頻率前三位分別為T(mén)P53(72%)、APC(63%)和KRAS(42%),癌癥信號(hào)通路突變圖譜與高加索人群相比差異較大,呈現(xiàn)出中國(guó)結(jié)直腸癌患者群體的獨(dú)有特征。在胚系變異方面,4.6%的患者攜帶DNA損傷修復(fù)通路相關(guān)的明確致病或可能致病性胚系突變,其中27.5%易感基因攜帶者發(fā)生因雜合性缺失或雙等位基因變異導(dǎo)致的“二次打擊”事件。

      此外,研究結(jié)果表明,BRAF和RBM10單基因驅(qū)動(dòng)突變是轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌較短無(wú)進(jìn)展生存期的獨(dú)立預(yù)后因素,且體外實(shí)驗(yàn)表明RBM10表達(dá)缺失促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、遷移并抑制凋亡。胡欣教授說(shuō):“這可能是導(dǎo)致結(jié)直腸癌復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的誘因之一?!?/span>

      基因組變異互作網(wǎng)絡(luò)分析共獲得65個(gè)共現(xiàn)和106個(gè)互斥潛在功能依賴(lài)性事件,其中KRAS/AMER1和KRAS/APC共現(xiàn)突變可加速藥物代謝,導(dǎo)致對(duì)以化療為基石的治療敏感性較差,從而使得患者在進(jìn)行化療時(shí)臨床獲益有限。

      發(fā)現(xiàn)“冷、熱”免疫微環(huán)境差異,優(yōu)化結(jié)直腸癌免疫治療療效預(yù)測(cè)機(jī)制

      研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),聯(lián)合基因組標(biāo)志物可優(yōu)化免疫治療療效預(yù)測(cè),且這種預(yù)測(cè)在本中心免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療隊(duì)列中得到驗(yàn)證。

      微衛(wèi)星高度不穩(wěn)定且插入缺失變異高負(fù)荷的腫瘤,在接受免疫治療后完全退縮,展現(xiàn)‘熱’免疫微環(huán)境特征,其高免疫原性腫瘤新抗原經(jīng)MHC-Ⅱ復(fù)合物遞呈給CD4+ T細(xì)胞而激活細(xì)胞毒效應(yīng)。相反,POLE功能性突變攜帶者接受免疫治療后,疾病發(fā)生進(jìn)展,盡管有極高的腫瘤突變負(fù)荷,但大量由非同義單核苷酸變異衍生新抗原的遞呈功能缺陷并多發(fā)耗竭,伴隨相對(duì)較少活化淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)、免疫檢查點(diǎn)表達(dá)及PD-1/PD-L1共定位等,整體呈現(xiàn)相對(duì)“冷”免疫表型。

      “這一發(fā)現(xiàn)提示我們可以據(jù)此優(yōu)化預(yù)測(cè)免疫治療療效的基因組標(biāo)志物,更精準(zhǔn)識(shí)別獲益人群,為廣大結(jié)直腸癌患者的精準(zhǔn)診療提供新希望”,徐燁教授表示。


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